Seit 2007 ist Prof. Dr. Filliger Dozent für Mathematik an der BFH-TI. Er entwickelte und unterrichtet mathematische Grundlagenmodule auf Bachelor- und Masterstufe, betreut Abschlussarbeiten und ist in der Forschung an den Instituten IEM und IODA tätig. Seit 2019 hält er zudem Gastvorlesungen an der École polytechnique fédérale de Lausanne (EPFL).
Nach seiner Promotion in angewandter Mathematik an der EPFL war er Postdoktorand in mathematischer Physik an der Universität Bielefeld (Gruppe von Peter Reimann) und wurde durch ein Stipendium der Alexander von Humboldt Foundation gefördert. Seine Ausbildung umfasst zudem ein Mathematikdiplom der Université de Neuchâtel sowie ein Maschinenbaustudium an der Hochschule Luzern; den beruflichen Einstieg bildete eine Ausbildung zum Maschinenzeichner bei der Schurter AG.